Džubák Petr M.D., Ph.D.
E-mail: petr.dzubak@upol.cz
Telefon: +420 585632150, +420 604851158
Skupiny: ÚMTM, LEM, PERSONÁL, VEDOUCÍ
O mně
Scientist and pediatrician involved in molecular and translational medicine (disease area oncology and infectious diseases), leader of research program Chemical Biology and Experimental Therapeutics at IMTM. Actively participated in the research of more than 20 national and international projects; member of advisory board of Cancer Research Foundation „Rakovina ve veřejná“, co-founder of spin-off company focused on manufacturing of molecular diagnostics. Published more than >140 papers and books/chapters, >3552 SCI citations, H-index 27, Prix de Pharmacie 2007 Ambassade de France – Sanofi-aventis, Premier Prix.
Specialties: Molecular and translational medicine, Oncology, Drug research and development, MOA, Drug resistance
Journals
Books & book chapters
Detection and quantification of cellular antigens using flow cytometry, 1.vyd., Olomouc, Palacky University, 2021, 28, 209-214, Dedication: LO1304, ISBN: 978-80-244-6049-9,
Laboratory Techniques in Cellular and Molecular Medicine, 1.vyd., Olomouc, Palacky University, 2021, 436 s, Dedication: LO1304, ISBN: 978-80-244-6049-9,
Hmotnostní spektrometrie, 1. vyd, korigovaný dotisk, Olomouc, Univerzita Palackého v Olomouci, 2021, 2.2, 34-42, ISBN: 978-80-244-3951-8,
Intellectual property
CARBONIC ANHYDRASE INHIBITORS AND METHOD OF THEIR PRODUCTION (Řezáčová)
- Published Application PV 2011-676 (2.5.2013)
- Published Application PCT/CZ2012/000106 under WO 2013/060307 (2.5.2013)
- Patent: EP 2771015; Granted: 16.3.2016; Ownership: Institute of Organic Chemistry and Biochemistry CAS, Institute of Molecular Genetics CAS, Institute of Inorganic Chemistry CAS, Palacky University Olomouc; Inventors: Brynda Jiří, Cígler Petr, Gruner Bohumír, Maloy Řezáčová Pavlína, Mader Pavel, Šícha Václav, Bakardijev Mario, Džubák Petr, Hajdúch Marián
- Patent: US 9,290,529; Granted: 22.3.2016; Ownership: Institute of Organic Chemistry and Biochemistry CAS, Institute of Molecular Genetics CAS, Institute of Inorganic Chemistry CAS, Palacky University Olomouc; Inventors: Brynda Jiří, Cígler Petr, Gruner Bohumír, Maloy Řezáčová Pavlína, Mader Pavel, Šícha Václav, Bakardijev Mario, Džubák Petr, Hajdúch Marián
Status: Terminated
BIOAVAILABLE DITHIOCARBAMATE-METAL COMPLEX NANOPARTICLES, METHOD OF PREPARATION AND USE THEREOF "DISULFIRAM I" (Škrott)
- Patent: EP 3459526. Granted: 24.2.2021. Ownership: Palacky University, Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
- Published Application PCT/EP2018/076098 under WO 2019/063601 (4.4.2019)
- Patent: AU 2018340510. Granted: 5.8.2021. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
- Patent: CA 3,076,855. Granted: 26.4.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
- Patent: KR 10-2456683. Granted: 14.10.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
- Patent: JP 2020-537873. Granted: 29.9.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
- Patent: MX 396,552. Granted: 17.10.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
Status: Available
DIOXOCYCLOBUTENYL HYDRAZONES AND THEIR ANTICANCER ACTIVITY (Kaplánek)
- Patent: CZ 305626; Granted: 2.12.2015; Ownership: Institute of Chemical Technology Prague, Palacky University Olomouc, Institute of Molecular Genetics CAS; Inventors: Havlík Martin, Kaplánek Robert, Dolenský Bohumil, Rak Jakub, Bříza Tomáš, Džubák Petr, Hajdúch Marián, Konečný Petr, Štěpánková Jana, Králová Jarmila, Král Vladimír
Status: Terminated
Postdoctoral mentorship
Znojek Pawel Ph.D.
HCT/HCA assays development
Stav: Probíhající od 2013 do 2015.
Doctoral mentorship
Burgetová Ječmeňová Kateřina
Drug resistance mechanisms in cancer
Stav: Ongoing od 2020.
Kotulová Jana Ph.D.
Identification of adenosine receptor modulators and their anticancer properties
Stav: Absolvoval od 2014 do 2022.
Stanková Jarmila
Cytotoxic drugs molecular target identification by methods of cell biology and proteomics
Stav: Probíhající od 2016.
Master mentorship
Burgetová Ječmeňová Kateřina
Development and characterization of resistant cell lines to purine and pyrimidine cytotoxic drugs
Stav: Absolvoval od 2018 do 2020.
Růžičková Eliška B.Sc.
Evaluation of biological activity of demethylation drugs
Stav: Absolvoval od 2013 do 2014.
Pastorková Barbora B.Sc.
Identification of molecular targets of anticancer drugs by immuno-affinity purification
Stav: Absolvoval od 2013 do 2014.
Bachelor mentorship
Lónová Kateřina
Development and basic characterization of the cell line resistant to the CDK inhibitors
Stav: Graduated od 2015 do 2016.
Volná místa
4 Lékařská biologie
| Projekt: | Genetic and epigenetic biomarkers of cancer diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Slavkovský Rastislav Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled air condensate in patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Antitumor drugs targeting nucleic acid metabolism |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Identification of molecular targets and mechanisms of resistance in antitumor drugs using cell biology and proteomics methods |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
1 Biomarkery: Identifikace a validace
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled breath condensate in patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Téma doktorské práce je zaměřeno na identifikaci biomarkerů plicních onemocnění pomocí neinvazivního odběru kondenzátu vydechovaného vzduchu. Projekt bude sledovat přítomnost proteinů ve vydechovaném vzduchu u různých onemocnění, jako je astma, cystická fibróza, nádory plic nebo některá infekční onemocnění, a také kvantitativní změny těchto proteinů ve srovnání se zdravou populací. Změny těchto potenciálních biomarkerů ve vztahu k odpovědi na léčbu a progresi onemocnění budou vyhodnoceny a validovány. |
2 Patofyziologie a nové cíle léků
| Projekt: | Identification of molecular targets of anticancer therapy applying cell biology and proteomics tools |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Vybrané vysoce aktivní deriváty triterpenů, chelátorů a nukleosidů budou studovány s cílem identifikovat mechanismy jejich protinádorových účinků. K jejich studiu budou využity pokročilé metody buněčné biologie, proteomiky a genomiky, jako je afinitní purifikace proteinových cílů, CETSA a další. Identifikované cíle budou validovány z hlediska jejich klinické relevance v protinádorové terapii. |
| Projekt: | Drug resistance mechanisms in cancer |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Budou studovány mechanismy rezistence nádorových buněk k nově vyvíjeným i stávajícím cytostatikům ze skupiny nukleosidových analog. Tato léčiva se používají ve většině protokolů protinádorové terapie a vznik lékové rezistence představuje zásadní problém v léčbě onkologických pacientů. Na dříve připravených rezistentních buněčných liniích budou identifikovány klíčové mechanismy rezistence, a to jejich podrobnou charakterizací metodami buněčné biologie, ale také proteomiky a molekulární genetiky. Význam identifikovaných změn bude dále ověřen na klinickém materiálu a bude uplatněn při vývoji nových protinádorových léčiv z této třídy. |
1 Molekulární a translační medicína
| Projekt: | Utilization of the space of unprecedented covalent inhibitors |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 1 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
7 Molecular and Translational Medicine
| Projekt: | Anticancer drugs targeting nucleic acid metabolism |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Genetic and epigenetic biomarkers in health and disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Slavkovský Rastislav Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Drábek Jiří Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 5 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Identification of molecular targets and resistance mechanisms of anticancer drugs by cell biology and proteomics methods |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in proximal fluids and tissues |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled breath condensate patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Innovative approaches to protein interaction modifiers |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Václavková Jana M.Sc. |
| K dispozici: | 1 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Research and development of agents for cancer, neurodegenerative and infectious diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | De Sanctis Juan Bautista Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Urban Milan Ph.D., Das Viswanath M.Sc., Ph.D. |
| K dispozici: | 5 |
| Určeno pro: | Doctoral training |